新聞 大陸新聞
中國率先完成草地貪夜蛾染色體基因組測序和組裝
華夏經緯網   2019-06-19 10:01:28   
字號:
近期熱詞
深港通  洪秀柱  樸槿惠  復興航空  菲德爾卡斯特羅  特朗普  “東方之星”長江傾覆  控煙  

    從蟲卵到成蟲,20天左右就完成一個世代。遷飛速度快、繁殖力強、食量特別大是入侵物種草地貪夜蛾的“標簽”。這種“幺蛾子”取食玉米、水稻、高粱等186種植物,危害甚深。從今年1月在西南邊陲普洱江城發現,半年過去,其子子孫孫已飛抵東北三省,橫掃中國版圖對角線。

  5月中旬,一場與飛行速度爭搶時間的科學研究也在接力進行。僅用25天,從害蟲采樣到論文發表,我國首次在全球完成對這種外來入侵者染色體級別的基因測序與組裝。

  “草地貪夜蛾基因組的解讀和深層次回答,對進一步研究其亞型、耐藥性和長期防控具有重要意義。”中國科學院院士、華大基因學院院長楊煥明18日在昆明表示,入侵生物的耐毒性與遺傳機制、確定入侵中國的樣本類型、遷飛路線、基因防御技術、雜食性遺傳機制等研究與應用,都離不開高質量參考基因組。

  華大生命科學研究院數字化地球研究所副所長劉歡介紹,從5月21日13:00接到任務指令到聯系好采樣,他們僅用時30分鐘;兩個小時后,確定了項目實施方案和樣本來源。次日,他們在廣州采到了樣本,同時來自云南的樣本送達深圳,當天就著手DNA提取等工作;第5天,就實現stLFR測序數據下機、5K大片段和WGS上機測序以及轉錄組上機;第10天,完成了物種鑒定和第一版雌雄兩個基因組組裝;第15天,轉錄組數據下機,完成組裝補洞和開始基因組注釋;第25天——6月15日,發布兩個染色體水平的基因組,確定侵入我國草地貪夜蛾亞型和可能來源,文章正式在BioRxiv發表。

  “人類基因組測序六個國家參與、花了十年時間;其他物種的組裝研究分析通常達到1年,算是快的。草地貪夜蛾的入侵,吹響了科研服務國家的號角,也讓我們創造了前所未有的速度。”劉歡說。

  在楊煥明院士領導下,云南農業大學、華大基因、中國科學院動物研究所、中國農業科學院等通力協作,動用了所有資源,與國內各省區以及美國樣本互動,產出了1.5Tb的基因組測序原始數據,目前完成了1雌1雄2個染色體水平的基因組組裝,兩個基因組組裝大小分別達到了542.42M和530.77M。

  “無論是基因組完整性還是基因集的完整性都超過了目前已有版本。”劉歡說,研究中通過基因注釋共發現了12516個基因家族。通過與8個近緣鱗翅目物種進行比較基因組學分析,發現了多個擴張基因家族,其中有兩個嚴重擴張,這意味著其在某些方面功能非常強,這或將為草地貪夜蛾的高度雜食性、抗藥性研究打下基礎。研究人員通過對草地貪夜蛾亞型分析表明中國種群有玉米型(C型)和雜合水稻型(R型)兩種類型,確定有非洲入侵,不排除其他地區入侵。值得一提的是,項目組所使用的stLFR和Hi-C技術均為自主研發技術,達到了國際領先水平。

  “這是一個涉及生態、民生、糧食安全乃至倫理等的科學課題,體現了參與科研機構和人員的擔當,以及科學與合作的精神。后續工作要盡快做、盡量做!”楊煥明院士說。

  與此同時,云南農業大學桂富榮教授等開展了草地貪夜蛾的災變機理及控制研究,陳斌教授等則圍繞生物多樣性控制生物災害展開研究,均取得初步進展。目前,基因組數據已上傳國家基因庫的中國核酸序列歸檔系統(CNSA)數據平臺,供全世界研究者公開下載使用。未來,項目組還將進一步開展耐毒性、轉錄組等方面的研究。

來源:科技日報

 

責任編輯:侯哲

共1頁
  網友評論 更多評論>>>
  網友: 密碼:   
 
 
 
  已有( ) 條評論 剩余 字 驗證碼:    
 
相關文章
   
·屠呦呦團隊談成就,謹慎更顯科學態度
·青蒿素耐藥?屠呦呦團隊:3日療程在部分地區正喪失療效
·5G輻射比4G大?錯!網速更快、基站更多≠輻射更大
·屠呦呦團隊成員談科研突破:苗頭很好 大量數據待積累
·外企中標5G采購,中國不“吃獨食”
·研習科技創新重要論述:以規劃引領創新 以創新驅動發展
·人工智能是否應該享有著作權?專家:法律規定尚未明晰
·北斗系統邁入全球時代:將“命脈”牢牢把握在自己手里
·屠呦呦:青蒿素依然是抗瘧首選藥物
·堅持開放合作:外企中標5G采購 中國不“吃獨食”
·屠呦呦團隊放“大招”:“青蒿素抗藥性”等研究獲新突破
·5G,打開巨大發展空間
·要買5G千元機,可能還得等1年
·中國5G發牌照引發國際社會熱議
 
推薦閱讀
   
·聚焦第29屆全國圖書交易博覽會
·中國發現亞洲首例霸王龍足跡
·《故宮里的博物學》:120種奇
·《哪吒》:見證中國動畫電影高光
·新時代的中國國防
·第三十屆香港書展:聚焦科幻推理
·策劃:臺灣青年大陸追夢、筑夢、
·《健康中國行動》
·臺灣軍購甘做“冤大頭”
·良渚古城遺址列入世界遺產名錄
·盤點2019年6月文化關鍵詞
·動員更多臺商臺胞支持 共享大灣
·聚焦第22屆上海國際電影節
·解放軍和武警部隊馳援宜賓抗震救
熱門點擊
  更多
11月27日至12月5日,習近平訪問西班牙、阿根廷、巴拿馬和葡萄牙并出席G20
習近平開啟亞太之行,并出席APEC第二十六次領導人非正式會議。
精彩時評
 
·網紅景點山洪奪命,“野景區”也應建立風險預警
·庭長“保證書”實不實,需要用事實來保證
·教師加班用餐猝死,四次不認定工傷是刁難
·唐偉:鼓勵醫師全職或兼職開診所當解后顧之
·江德斌:打擊惡意搶注商標,維護市場公平秩
·信息流模式也得合法合規
·別把代餐品錯當“減肥神藥”
新聞推薦
  更多
·臺胞中小學夏令營徐州開展“漢文化研學之旅”
·兩岸臺胞中小學生“放飛夢想” 夏令營舉辦
·民航局新規擬規定:嚴禁機票默認搭售潛規則
·男子在朋友圈罵人被罰1000元 法官:名譽侵權
·受波音737MAX禁飛影響 瑞安航空將大舉裁減員工
·美國總統宣布降半旗哀悼槍擊案遇難者
·印尼垃圾分類:人工智能派上用場
精彩博文
 
·[張富學]大陸應積極應對金門期盼實行一國兩制訴求
·[袁周]印航更名對蔡英文所謂“維持現狀”的警示
·[賈永輝]融合發展 匯聚起兩岸和平發展強大正能量
·[陽光不銹]網信辦整頓娛樂八卦賬號 “全民星探”等被關
·[寵辱不驚]地鐵設女性車廂防色狼? 大聲說“不”更有效
·[坐看云起]各國考試防作弊啥招? 印度高科技韓國查廁所
·[張良驊]臺灣人為何對大陸“好感”首次超越“反感”
華夏周刊
  更多
新聞排行
   
工薪階層應該如何理財:宜人貸、和信貸、銀
這輛超美的廢棄大巴里藏著90后女孩的植物
郁俊:新時代的傳祺“智能制造”在宜昌分廠
德國黑科技減肥水杯來了 J&H智能碎碎杯
健康生活從殺菌開始,便攜Bet365殺毒
止痛藥芬太尼何以成了新一代毒品之王
板門店再開“和平之花” 韓朝會談敲定冬奧
賞櫻團車禍事故33人死 "藍委"要官員負
紀念解放軍海軍成立60周年多國海軍活動今
第19屆新絲路中國模特大賽總決賽在三亞落
  圖片新聞   更多
  精彩視頻   更多
新聞中心
大陸新聞 | 臺灣新聞 | 港澳新聞 | 國際新聞 | 綜合新聞 | 圖片新聞 | 熱門點擊 | 重大新聞 | 滾動新聞 | 國臺辦新聞發布會 | 熱門評論 | 新聞說吧
媒體時評 | 看 世 界 | 國際熱點 | 港澳風情 | 大陸人看臺灣 | 社會廣角 | 酷文辣評 | 星聞情報站
---華夏經緯網版權所有---
三肖两码中特网